原文:5.MCScanX 与circos下载、安装、运用

一 MCSCAN 参考 :http: chibba.pgml.uga.edu mcscan MCScanX.zip http: chibba.pgml.uga.edu mcscan tm 安装 :unzip MCscanX.zip amp amp cd MCScanX amp amp make 安装报错: 报错解决: 这个错误的原因是,MCScanX 不支持 位系统。如果要在 位上运行,需要修改下 ...

2019-07-25 20:02 0 642 推荐指数:

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从基因组可视化工具——circos说起,circos安装

这是博客改版的第一篇博文,选择最近使用的生物信息学软件——circos开始写起。circos是用perl写的生物软件,从发表的文章来看 学习circos主要是熟悉配置文件的编辑方法,搞清楚其中的标签、参数的含义。只有完全清楚了这些东西才能够轻松自如的让circos ...

Thu Jul 28 19:02:00 CST 2016 0 2308
Circos

Circos官网 http://circos.ca 在线绘图工具 http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/ Circos图的诞生 Circos图诞生于2009年,当时是作为一个绘图工具类的文章发表在Genome Research(最新 ...

Mon Sep 16 17:58:00 CST 2019 0 503
Selenium运用-漫画批量下载

今天我们要爬去的网站是http://comic.sfacg.com/。漫画网站一般都是通过JavaScript和AJAX来动态加载漫画的,这也就意味着想通过原来爬取静态网站的方式去下载漫画是不可能的,这次我们就来用Selenium&PhantomJS来下载漫画。 分析 ...

Sun Aug 27 06:59:00 CST 2017 0 1177
Circos绘图—基础

之前看过一张关于人口迁徙的图,感觉很惊艳,后面了解到Circos这个工具,虽然主要是用于染色体基因组的图的绘制,但是在其他方面也是有着很好的可视化效果 汽车交易中的用户行为模式追踪 How do customers "flow" between brands and car segments ...

Sat Feb 15 07:29:00 CST 2020 0 4343
Circos入门教程

1 Circos简介 Circos是一个非常酷炫的基因组数据可视化软件,能够将基因组数据映射到环形的基因组坐标上,用相互嵌套的环道来展示基因组数据,还可以通过连接线来呈现基因组区块之间的关系。Circos的开发者是一位加拿大的生物信息学家Martin Krzywinski,值得一提的是 ...

Fri Nov 12 19:00:00 CST 2021 0 13012
Circos软件学习

  circos 是一款perl 语言开发的画图软件,提供了染色体相关数据的一种可视化方式。其制作的图表精美,被科研工作者广泛使用。Circos可以对染色体相关数据进行可视化,以每条染色体为一个扇区,组成一个圆形,如图1所示。也可以对其他表格形式的数据进行可视化,以每个样本作为扇区,以其上的特征 ...

Sun May 10 19:36:00 CST 2020 0 724
requests的安装与简单运用

参考链接 http://www.zhidaow.com/post/python-requests-install-and-brief-introduction 1. 安装 下载安装包地址:https://github.com/requests/requests.git ...

Thu Jul 12 19:15:00 CST 2018 1 3508
 
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