原文:R包MetaboAnalystR安装指南(Linux环境非root)

前言 这是代谢组学数据分析的一个R包,包括用于代谢组学数据分析 可视化和功能注释等众多功能。最近有同事在集群中搭建蛋白和代谢流程,安装这个包出现了问题,于是我折腾了一上午。 这个包的介绍在:https: github.com xia lab MetaboAnalystR,安装确实还比较复杂,依赖的东西太多太多。废话不多说,记录下安装历程。 安装过程 首先最好是已经安装了自己的R版本 非root , ...

2019-07-17 16:01 0 775 推荐指数:

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[Linux]rootR环境被conda破坏后如何恢复?

记录说明 这篇文章本来是用来记录Linuxroot环境安装PMCMRplus折腾过程,但后来试过了各种方法安装不上这个R后,我换上了Miniconda来安装。经前人提醒,一开始安装Miniconda我是没加入环境变量的。但一直激活不了虚拟环境,所以后来我又加入了环境变量试着安装,结果这一 ...

Tue Oct 15 06:59:00 CST 2019 0 477
linuxroot用户下安装软件,搭建生产环境

之前的用实验室的服务器,因为某些原因,使用的用户没有root权限。linuxroot用户很多软件无法安装,非常的不方便。我的方法是使用brew来代替系统的包管理工具。brew是最先用在mac上的包管理工具,可以将所有的托管在user本地的环境内。下面的文档中运行的时候记得将用户名改成 ...

Wed Sep 18 00:40:00 CST 2019 0 717
Linux环境root用户安装Python3

安装python-3.8.1: 系统环境:Centos 7 在python官网上下载相应的Linux版本:https://www.python.org/downloads/source/。这里首先安装Python-3.8.1,下载,解压: 创建安装目录 ...

Sun Aug 02 00:08:00 CST 2020 0 1004
Linux环境RR安装及其管理

前言 R对windows使用很友好,对Linux来说充满了敌意。小数据可以在windows下交互操作,效果很好很棒。可是当我们要处理大数据,或者要在集群上搭建pipeline时,不得不面对在Linux上装R及想要的R这个难题,尤其是对root用户而言更是艰难重重。 准备依赖库 依次安装 ...

Thu Jun 06 22:57:00 CST 2019 0 9730
Linux 互联网环境安装依赖

1 介绍 有的生产环境是没有网络的,我们部署rpm的时候会出现缺少很多rpm的依赖问题,都去网上下载实在太麻烦,今天介绍一个办法可以解决这一问题。 2 解决方案 找一台可以联网的机器,在上边下载相应的rpm。 使用命令: #yum install ...

Fri Jul 12 21:10:00 CST 2019 0 600
linux root 用户安装redis 安装

1,在Linux环境上下载gcc,通过源码安装得通过cc编译器进行安装。这时候得下载gcc。这时候使用root用户进行安装。 yum -y install gcc 2,接着编译需要使用jemalloc。得下载jemalloc 编译。使用yum安装得添加一下仓库源。改完仓库源,这时候 ...

Tue Mar 03 05:45:00 CST 2020 0 3654
linux下子用户(root安装python

1、源码安装python > cd /home/username/ > wget https://www.python.org/ftp/python/3.6.8/Python-3.6.8.tgz > tar -xzf Python-3.6.8.tgz > cd ...

Fri Mar 12 09:10:00 CST 2021 0 256
 
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