原文:序列相似性比较与同源性分析

首先应该注意区分序列相似性与序列同源性的关系,序列相似不一定同源,但是判定同源性关系的时候有些算法 Maximum likelihood除外 要考虑到序列相似性。序列相似性是将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较,用于确定该序列的生物属性,也就是找出与此序列相似的已知序列是什么,完成这一工作只需要用到两两序列比较算法,常用的程序包有BLAST,FASTA等。同源性分析是将待研究序列加入到一组与 ...

2019-07-12 22:18 0 7042 推荐指数:

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时间序列分析 | 相似性度量基本方法

前言 时间序列相似性度量是时间序列相似性检索、时间序列无监督聚类、时间序列分类以及其他时间序列分析的基础。给定时间序列的模式表示之后,需要给出一个有效度量来衡量两个时间序列相似性。时间序列相似性可以分为如下三种: 1、 时序相似性 时序相似性是指时间序列点的增减变化模式相同,即在 ...

Fri Jul 16 23:26:00 CST 2021 0 732
【Matlab】彩色图像的相似性比较

基于灰度直方图匹配(直方图的交),设计并编程实现一种彩色图像的相似性计算方法。 一、基本思路: 将彩色图分为三通道(RGB),并计算各自的直方图,对两幅图的RGB三通道分别进行直方图匹配,最终对三个匹配结果求平均值。 二、算法及算法流程: 1.应用的算法: 2.算法流程: 硬件 ...

Thu Sep 12 17:56:00 CST 2019 0 945
信号相似性的描述

信号相似性的描述 在很多的应用场合,经常要描述两个信号的相似性。比如在雷达的信号检测中,要比较所接收的信号是否就是发射信号的延时。有时候,甚至还要描述一个信号本身的相似性,比如在语音编码中,要通过语音信号本身的相似性,来预测下一时刻的信号值。 我们知道 ...

Wed Dec 11 19:09:00 CST 2013 0 2431
聚类分析(一):相似性度量

1.欧式距离    衡量样本间相似性和差异性的方法就是计算两个样本之间的距离。    对于距离,我们最熟悉的莫过于欧式距离,设\(a=(x_1,x_2,\cdots,x_n),b=(y_1,y_2,\cdots,y_n)\),那么\(a\)和\(b\)的欧式距离定义为: \[ d(a,b ...

Thu Apr 08 06:43:00 CST 2021 0 352
英文句子相似性判断

1.要求   本次项目提供一系列的英文句子对,每个句子对的两个句子,在语义上具有一定的相似性;每个句子对,获得一个在0-5之间的分值来衡量两个句子的语义相似性,打分越高说明两者的语义越相近。 如: 2.基本实现过程 2.1 数据处理: (1) 分词: (2)去停用 ...

Thu Mar 29 05:02:00 CST 2018 0 2831
向量的相似性度量

距离计算方法总结   在做分类时常常需要估算不同样本之间的相似性度量(Similarity Measurement),这时通常采用的方法就是计算样本间的“距离”(Distance)。采用什么样的方法计算距离是很讲究,甚至关系到分类的正确与否。   本文的目的就是对常用 ...

Thu Oct 27 05:38:00 CST 2016 0 27949
 
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