amber中pdb4amber简单用法
以如下命令举例： 命令中： -i 代表pdb输入 -o 代表pdb输出 -d 代表dry，去除所有水 -s 代表去掉以ATOMMASK为标准的原子，这里去掉了Cl-和Na+ ...
原文：amber初学……
以下是分子动力学模拟的一般性步骤, 具体的步骤和过程依赖于你研究的体系和所用的软件, 但这并不影响我们把它当作一个入门指南. . 评估体系首先需要对我们要进行模拟的体系做一个简单的评估, 有三个问题是我们必须要明确的: . 选择工具选择合适的模拟工具, 大前提是它能够实现你所感兴趣的目标. 这需要你非常广泛谨慎地查阅文献, 看看别人用这些工具都做了些什么, 有没有和你的研究体系类似的, 相关的研究 ...
2019-07-12 11:12 0 694 推荐指数：
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