原文:Gene Ontology (GO) 注释

Gene Ontology GO 注释 Posted on In生信 相似的基因在不同物种中,其功能往往保守的。显然,需要一个统一的术语用于描述这些跨物种的同源基因及其基因产物的功能,否则,不同的实验室对相同的基因的功能的描述不同,将极大限制学术的交流。而 Gene Ontology GO 项目正是为了能够使对各种数据库中基因获基因产物功能描述相一致的努力结果。 所谓的 GO,是生物学功能注释的一 ...

2019-07-11 16:43 0 530 推荐指数:

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Gene Ontology (GO) 简介

为了查找某个研究领域的相关信息,生物学家往往要花费大量的时间,更糟糕的是,不同的生物学数据库可能会使用不同的术语,好比是一些方言一样,这让信息查找更加麻烦,尤其是使得机器查找无章可循。Gene Ontology就是为了解决这种问题而发起的一个项目。 Gene Ontology中最基本的概念 ...

Tue Mar 20 04:54:00 CST 2012 0 6610
gene Ontology (基因本体论)

gene ontology为了查找某个研究领域的相关信息,生物学家往往要花费大量的时间,更糟糕的是,不同的生物学数据库可能会使用不同的术语,好比是一些方言一样,这让信息查找更加麻烦,尤其是使得机器查找无章可循。Gene Ontology就是为了解决这种问题而发起的一个项目。 Gene ...

Wed Dec 12 21:59:00 CST 2018 0 646
Ontology

本体网络(Ontology) 新一代分布式信任链网 在开始了解项目之前,让我们先看一段“第一财经”频道关于“本体网络”的介绍: 项目介绍 1摘要 类型 提供不同分布式应用场景的开放基础模块,构建跨链、跨系统、跨行业、跨应用和跨终端的分布式信任基础设施 ...

Sun Feb 25 00:32:00 CST 2018 0 3557
gene ID转换(gene ID转为protein ID) pathway注释 string数据库的方法 UniProt

如果转载,请注明出处。 GSEA、David与KEGG、GO数据库的区别: 1.KEGG数据库、GO数据库是知识库。它们记录了通路、生物学过程等的信息。 2.GSEA、David是做富集分析的数据库。它们使用KEGG、GO数据库中的信息,再结合你输入的基因列表,对输入基因列表进行富集 ...

Sat Oct 19 15:46:00 CST 2019 0 1072
GO注释

1、GO资源简介 由于生物系统的惊人复杂性和需要分析的数据集的不断增加,生物医学研究越来越依赖于以可计算的形式存储的知识。基因本体论(GO)项目为基因功能和基因产物的可计算知识提供了目前最全面的资源。GO知识库由两个主要部分组成: 基因本体论Gene Ontology (GO),提供了生物功能 ...

Sat Jan 26 07:05:00 CST 2019 0 1395
批量注释基因到基因座上(map gene to locus)

GWAS研究中经常涉及到基因座(locus)的概念,下面简要介绍一下批量注释基因到基因座的方法。 1、单个基因注释到基因座 对于单个基因的基因座注释,比较简单,常用的工具有:UCSC Genome Browser、NCBI。 比如UCSC Genome Browser: 还有NCBI ...

Tue Sep 07 04:54:00 CST 2021 0 111
植物GO注释

本文主要是对没有GO term库的植物进行注释。 1、选用AgriGo 进行注释,在agriGO中点击species后,查看与你目标物种相近的物种作为库 2、比如我以甜菜为例 为了找到和GO term对应的ID,先找到PLAZA,进入网站https ...

Mon Sep 09 22:05:00 CST 2019 0 361
GO | KEGG的注释是怎么来的?

我们是在验证时才使用注释,这种拿不准确数据来验证新的数据的方法确实值得思考。 那么GO和KEGG常见注 ...

Tue Aug 07 20:02:00 CST 2018 0 2592
 
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