安装办法参考自B站UP主【百科全叔】的文章 半条命模组在ModDB站上下载资源 mod文件位置 一些模组是可以直接运行的,下载解压后双击目录 ...
做单细胞RNA seq分析,自然就能想到我们测到的其实是一个概率学的东西,就像女士品茶里的酵母的泊松分布一样。 真实的细胞里,一切都是连续的,从DNA到mRNA到蛋白,是有一个时间间隔的,每一个process也不是瞬间完成的,而是有一个周期,我们可以叫做半衰期。 看一篇文献先:Database for mRNA Half Life of Genes Obtained by DNA Microarr ...
2019-07-09 20:29 0 416 推荐指数:
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参考: 分子生物学教材 再一次,翻看真核生物基因结构! mRNA基本结构特点 Structure and function of Messenger RNA (mRNA ) 基因结构 其实这个结构不完整,完整的如下: 主要注意UTR这个结构 真核生物的基因 ...
做RNA-seq的数据分析,一直弄不清楚实验过程,最近有时间就找一些资料来了解一下,同时将整理的资料记录下来,方便以后查找。 来源资料:【3D演示】基因的表达(原版+字幕版) 人体从食物中获取营养的过程也就是化学消化过程,是通过酶对食物进行分解来得到营养物质。DNA用来制造酶和各种蛋白质。DNA ...
做差异表达的软件DEseq和edgeR所需要的数据格式必须是原始counts,经过normalization和log2后的数据都不适合,所以对于做差异表达计算的童鞋可以使用ExperimentHub下载TCGA的原始数据。 GEO地址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov ...
基因表达式编程(Gene Expression Programming,GEP)是由葡萄牙科学家Candida Ferreira 2001年提出来的一种新型遗传算法,其特点是将基因型和表现型分离。GEP 继承了GA的快速、易用和GP的易变、多能,比GA,GP提高速度100 - 1000000倍 ...
做了好久的RNA-seq分析,基因表达也在口头溜了几年了,但似乎老是浮在表面。 对一件事的了解程度决定了你的思维深度,只想做技工就不用想太多,想做大师就一定要刨根问底。 老是说基因表达,那么什么是基因表达?我们测序得到的基因表达其实只是一种表型,是样本的一个快照,和普通的身高体重之类的连续型 ...
#http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2881355/ 一致聚类方法,采用重抽样方法来验证聚类合理性。 library(ALL)data(ALL)d=exprs(ALL)d[1:5,1:5] #对上面这个芯片表达数据我们一般会简单的进行 ...
接前一篇: 用R和BioConductor进行基因芯片数据分析(五):芯片间归一化 经过一系列的预处理,包括缺失值填充,中位数计算以及归一化,我们的数据终于可以用啦。 下面我们就来分析一下new population和old population的个体是否有差异表达基因。 判断一个基因是否 ...