可变剪切 | isoform | PSI | 单细胞 | suppa
suppa2继续测试，这个软件真的非常好用，速度很快、文档清晰、使用方便。 suppa核心文件: https://github.com/comprna/SUPPA ~/references/SUPPA2/ref/hg19 ...
原文：SUPPA 可变剪切分析
SUPPA是一款通过转录本定量来获取可变剪切定量结果的软件。转录本的定量方式有很多，例如count，FPKM, TPM等，作者建议使用TPM，因为先均一化了基因的长度，然后均一化了测序的深度。同时建议使用salmon软件进行定量 软件的下载与安装 首先下载salmon二进制版本 下面使用小鼠的转录本来建立索引 使用salmon建立索引 SUPPA 的安装，需要注意的是SUPPA 是使用pytho ...
2019-07-01 14:09 0 1357 推荐指数：
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