原文:用Python实现一个爬虫爬取ZINC网站进行生物信息学数据分析

最近接到实验室的导师交给我的一个任务,就是他们手头有很多smile表达式,格式类似这种:C C c ccccc c ccccc c ccccc 这是生物信息学中表达小分子结构的一种常用表达式 ,他们需要对每个smile表达式在ZINC网站 生物信息学数据网站 上进行搜索,然后找到对应的ZINC号 小分子供应商 构象预测等信息。基本步骤如下: 点击查找之后网页就会跳转到详细信息,我们需要获取它的Z ...

2019-06-02 12:34 0 516 推荐指数:

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Python生物信息学数据管理》中文PDF+英文PDF+代码

生物信息学经典资料,解决生物学问题,通过“编程技法”的形式,涵盖尽可能多的组织、分析、表现结果的策略。在每章结尾都会有为生物研究者设计的编程题目,适合教学和自学。由六部分组成:Python语言基本介绍,语言所有成分介绍,高级编程,数据可视化,生物信息通用包Biopython,最后给出20个"编程 ...

Wed Jun 05 19:09:00 CST 2019 0 646
生物信息学常识汇总

电子病历方向 电子病历方面主要是筛选出冠心病影响的因素,通过抽取数据数据缺失处理、数据文本校对、数据对齐等方式进行预处理,经过各种病的数据统计以后能够进行方向的确定,然后进行小样本分析,从而进行探索,相当于在机器学习这个层面还需要重新进行学习,感觉也会增加自己的时间成本。 心脑血管疾病 ...

Thu Jun 25 04:12:00 CST 2020 0 861
python数据分析

一.python爬虫使用的模块   1.import requests   2.from bs4 import BeautifulSoup   3.pandas 数据分析高级接口模块 二. 数据在第一个请求中时, 使用BeautifulSoup   三.当数据不在第一个请求 ...

Sun Oct 20 03:02:00 CST 2019 0 1900
生物信息学: 导论与方法 | 总结笔记

课程链接:生物信息学: 导论与方法 1 导论与历史 1.1 1-1 什么是生物信息学 1.2 1-2 生物信息学历史 1.3 1-3 中国大陆的生物信息学 2 序列比对 2.1 2-1 序列比对中的基本概念 2.2 2-2 利用 ...

Tue Jul 26 00:35:00 CST 2016 0 11922
生物信息学在线软件集锦

序列相关 密码子表达优化:Jcat 核酸翻译为蛋白:Translate 序列比对和搜索:NCBI Blast,Uniprot Blast,HMMER,HHblits 序列比对的作图 ...

Wed Sep 02 22:49:00 CST 2020 0 437
 
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