用R的igraph包来画蛋白质互作网络图 | PPI | protein protein interaction network | Cytoscape
igraph语法简单，画图快速。 Cytoscape专业，个性定制。 最终效果图： 当然也可以用Cytoscape来画。 参考：Network visualiza ...
原文：PPI | protein-protein interaction | 蛋白互作分析 | gene interaction | 基因互作
前言 做RNA seq基因表达数据分析挖掘，我们感兴趣的其实是 基因互作 ，哪些基因影响了我们这个基因G，我们的基因G又会去影响哪些基因，从而得到基因调控的机制。 直觉确实是很明确的，但是细节处却有很多问题。 我们讨论的到底是基因表达的互作，还是基因产物的互作 对于蛋白编码基因，它翻译产生蛋白，如果此蛋白不参与转录过程，理论上不可能会影响另一个基因的表达，那也就不存在基因表达的互作的，它们的基因表 ...
2019-05-15 13:34 0 3059 推荐指数：
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