原文:使用Cytoscape画PPI网络图

打开Cytoscape软件,根据菜单导入string interactions.tsv文件 File gt Import gt Network from File 会弹出下图对话框,在对话框中设置如下: 选中string interactions.tsv文件,点击打开,导入文件,结果如下图所示。 点击OK,弹出如下视图,ctrl A选中所有基因节点 使用NetworkAnalyzer分析调整网络图 ...

2019-04-03 23:10 0 2758 推荐指数:

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利用cytoscape网络图

首先做出下面的基因间相互关系 1.准备sif文件 data.sif 网络数据文件 gene1 pp gene2 gene3 gene4 gene5 gene6 gene7 gene8 gene9 node.txt 网络属性文件 gene expgene1 0.2gene2 ...

Fri Dec 09 04:40:00 CST 2016 0 5713
python社交网络图

在图书馆的检索系统中,关于图书的信息里面有一个是图书相关借阅关系。跟这个社交网络图是一样的,反映了不同对象间的关联性。利用python社交网络图使用的库是 networkx import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt G ...

Mon Apr 10 06:41:00 CST 2017 0 4688
什么是网络图(Project)

一种使用节点表示工作、箭线表示工作关系的项目网络图。”所以这里有两个信息:节点和箭线。 然后我 ...

Sun Jul 12 00:23:00 CST 2020 0 1150
 
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