可变剪切调控因子motif基因富集分析 | motif enrichment | FIMO | MEME
类似篇：转录因子motif TSS区域富集分析 | motif enrichment | HOMER | FIMO | MEME 一个新的领域，现在我关注的是可变剪切调控因子，如PTBP1，它们有特定的RNA结合motif，类似TF。 相同点： 都是蛋白质的序列结合区域 ...
原文：HOMER | MEME | 转录因子的靶基因预测 | motif富集分析
转录因子motif是一些很短的模序 bp ，在大基因组里很容易出现随机比对，而且是以position weight matrix PWM 格式来呈现，说明它的可变性，因此研究motif有哪些binding区域是没有意义的，因为很难找到一个方法 阈值 来判断真正的比对和随机的比对。 换个思路，如果做富集分析，那就稳了，给定一个指定的区域 promoter或enhancer区域 ，根据统计学检验，我 ...
2019-04-17 12:49 0 4103 推荐指数：
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