一、什么是多基因风险评分 传统的GWAS研究只计算单个SNP位点与表型之间的关联性，再用Bonferroni校正，通过给定的阈值，筛选出显著的SNP位点。 这样会存在两个问题，第一、Bonferroni校正非常严格，很多对表型也有贡献的位点会因为达不到阈值而被过滤掉。第二 ...

前段时间有位小可爱问我，为什么她的QQ图特别飘，如果你不理解怎样算飘，请看下图： 理想的QQ图应该是这样的： 我当时的第一反应是：1）群体分层造成的；2）表型分布有问题。因此让她检查一下数据的群体分层情况，如果没有问题就看一下表型分布。 这段时间有空了，我觉得有必要梳理一下这个飘逸 ...

数据预处理（DNA genotyping、Quality control、Imputation） QC的工作可以做PLINK上完成Imputation的工作用IMPUTE2完成 2. 表型数据统计分析 ...

一、为什么要做GWAS的条件分析（conditional analysis） 我们做GWAS的时候，经常扫出一堆显著的信号，假设rs121是我们扫出来与某表型最显著相关的位点（P=1.351e-36），rs124尾随其后(6.673e-22)，也是与该表型显著相关，那么这个时候，我们就有问题 ...

1、软件下载，下载地址：https://github.com/genetics-statistics/GEMMA/releases 下载过程： 2、调用测试 ...

。 3、绘制图表 然后就可以通过 echarts.init 方法初始化一个 echa ...

Matlab 语谱图(时频图)绘制与分析 语谱图：先将语音信号作傅里叶变换，然后以横轴为时间，纵轴为频率，用颜色表示幅值即可绘制出语谱图。在一幅图中表示信号的频率、幅度随时间的变化，故也称“时频图”。 图1 数字0-10波形图 图2 数字0-10语谱图 图3 语谱图简单分析 ...

plink进行阈性状（质量性状）关联分析有两种方法 --assoc 和 --logistic， 这两种方法又分别有分是否校正： --assoc --adjust 和 --logistic --adjust --logistic方法有可以选择是否添加协变量： --logistic ...