原文:GEO数据下载及处理详细过程

GEO R 如果出现提示,请指定GEO系列加入和平台。 单击 定义组 并输入您计划比较的样品组的名称,例如测试和控制。 将样本分配给每个组。 突出显示Sample行,然后单击组名称以将这些Samples分配给该组。 使用样本元数据 标题,源和特征 列可帮助确定哪些样本属于哪个组。 单击 前 以使用默认设置执行计算。 结果表示为按显着性排序的基因表。 提出了前 个基因,可以将其视为轮廓图。 或者,可 ...

2019-03-15 21:48 0 985 推荐指数:

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芯片数据分析步骤1 芯片数据下载-GEOGEO数据下载数据的方法

GEO数据下载数据的方法 1、在GEO DATASETS中输入关键词,选择符合的GSE,在ftp中进行 手动下载 2、找到符合的GSE,在R中使用 GEOquery 包进行下载 GEO数据库的数据种类 1、Platforms 平台 包含有芯片的探针信息,如cDNAs,寡核苷酸 ...

Wed Jun 30 19:57:00 CST 2021 0 317
12、geo数据上传

1、注册一个NCBI账户     注册geo账户(老用户和新用户):  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/  有3个月的时间   GEO DataSets  >>  GEO Home  >>  Login ...

Mon Jul 10 22:17:00 CST 2017 0 1437
数据处理过程核心技术ETL详细介绍

架构挑战 1、对现有数据库管理技术的挑战。 2、经典数据库技术并没有考虑数据的多类别(variety)、SQL(结构化数据查询语言),在设计的一开始是没有考虑到非结构化数据的存储问题。 3、实时性技术的挑战:一般而言,传统数据仓库系统,BI应用,对处理时间的要求并不高。因此这类应用通过建模 ...

Mon Mar 25 19:20:00 CST 2019 0 3981
GEO/SRA数据

GEO数据GEO数据库隶属于NCBI,是最大最全面的基因表达数据库,主要是芯片和转录组测序数据。除储存数据外,也提供一些数据挖掘工具,因此利用好这个数据库,没有实验,没有自己的数据也能发好文章! https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo ...

Wed Sep 06 21:51:00 CST 2017 0 2293
I/O中断处理详细过程

1.CPU发送启动I/O设备的命令,将I/O接口中的B触发器置1,D触发器置O。 2.设备开始工作,需要向CPU传送数据时,将数据送入数据缓冲器中。 3.输入设备向I/O接口发出“设备工作结束”的信号,将D触发器置1,B触发器置0。标志着I/O设备已就绪。 4.CPU在每条指令执行即将结束时 ...

Sun Jan 06 21:30:00 CST 2019 0 4061
服务器处理请求详细过程

服务器处理请求详细过程 前言   百度了一下才知道,传智的邹老师桃李满天下呀,我也是邹老师的粉丝,最开始学习页面生命周期的时候也是看了邹老师的视频。 本人是参考了以下前辈的作品,本文中也参合了本人心得,绝非有意盗版,旨在传播,最主要是日后在下也可以参考一下,原版 ...

Sat Oct 12 05:44:00 CST 2013 0 6373
 
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