前面已经讲解了: 单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing 单细胞分析实录(2): 使用Cell Ranger得到表达矩阵 单细胞分析实录(3): Cell Hashing数据拆分 单细胞分析实录(4): doublet检测 单细胞分析实录(5): Seurat标准流程 单细胞 ...
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2019-03-14 20:13 0 814 推荐指数:
前面已经讲解了: 单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing 单细胞分析实录(2): 使用Cell Ranger得到表达矩阵 单细胞分析实录(3): Cell Hashing数据拆分 单细胞分析实录(4): doublet检测 单细胞分析实录(5): Seurat标准流程 单细胞 ...
一、单细胞测序简介 单细胞测序技术(single cell sequencing)是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术,它能够弥补传统高通量测序的局限性,揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。 我们经常看到的scRNA-seq ...
三、单细胞测序原理 今天主要介绍单细胞测序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前单细胞测序的两大主流平台,所以今天的单细胞测序原理介绍也是基于这两个平台的。 (1)10X Genomics单细胞测序原理 上图是10X单细胞测序的原理图。首先要 ...
单细胞测序的知识 刘小泽 已关注 2018.07.20 21:33* 字数 1885 阅读 675评论 0喜欢 7 刘小泽写于18.7.20https://hemberg-lab.github.io ...
之前写过一篇细胞类型注释的推文:单细胞分析实录(7): 差异表达分析/细胞类型注释,里面介绍了细胞类型注释的两种思路。在谈到自动注释时,我们基本都会用SingleR这个软件,类似的软件还有很多,原理上可能五花八门,但表现不一定有SingleR好。很多软件在做注释时会基于某个细胞和参考细胞表达谱 ...
Seurat是一个老牌的单细胞分析工具了(satija的力作),我之前测试过,但是没怎么用。 最近发现这个工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下这篇文章。 Integrating single-cell transcriptomic data across ...
第12周学校开展“师徒共上一节课”活动,我们选的课题是《单细胞生物》,本节内容是在学习了植物细胞的结构、动物细胞结构及细胞生活的基础上,让学生知道生物体有多细胞的动物体和植物体以外,告诉学生生物体也有单细胞的,它们没有复杂的结构,是否与多细胞生物体一样,能够独立完成各项生命活动呢?因此,第四节 ...
单细胞测序技术是指在单个细胞水平上对转录组或基因组进行扩增并测序,以检测单细胞在基因组(结构变异-Structural Variations-SVs;拷贝数变异-Copy number variants-CNVs;单核苷酸变异-Single nucleotide variants-SNVs ...