使用trim_galore软件遇到的问题
我的原始测序数据是双端测序，在用trim_galore软件去接头的这一步，使用的命令行是 相当然的以为软件会默认为双端测序，结果接下来一步用tophat软件mapping到参考基因组上的时候，发现mapping率只用10%，低的惊人。后来排除建库失败的可能，我去查看 ...
原文：Trim Galore用法及参数考量
Trim Galore是一个非常流行的用于 去接头序列 的软件，用于处理高通量测序得到的原始数据。通常我们从测序公司拿到数据后，第一步就是评估数据的质量以及对raw data去接头处理。公司拿来的数据通常附带了clean data以及去接头的说明文件，我自己重新实现了一下trim的过程。参数都是根据公司的说明文件来设定的。 软件说明 版本信息 Trim Galore version: . . Cu ...
2019-01-21 12:04 0 3092 推荐指数：
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