SAM/BAM文件处理
当测序得到的fastq文件map到基因组之后，我们通常会得到一个sam或者bam为扩展名的文件。SAM的全称是sequence alignment/map format。而BAM就是SAM的二进制文件(B取自binary)。 那么SAM文件的格式是什么样子的呢？如果你想真实地了解SAM文件 ...
原文：SAMTOOLS使用 SAM BAM文件处理
怪毛匠子 整理 samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 第一步：把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system samtoolsview bSmap.sam gt map.bam 第二步：sort一下BAM文件,得到map.sorted.bam system samtoolssortmap.b ammap.sorted 第三步：创建一个关于bam的索引文件,我们 ...
2018-12-27 09:35 0 6697 推荐指数：
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