原文:生物信息软件安装(不定时更新)

以本地电脑wsl子系统的unbantu为例 软件安装 anaconda安装与配置 下载Anaconda . for Linux https: www.anaconda.com download 在下载目录下输入 点yes往下后,输入查看是否安装成功 结果为 更新环境配置 增加源 channels 现在anconda下载好了 .faToTwoBit安装 将fasta格式改为 . bit格式 .安装 ...

2018-12-24 13:54 0 939 推荐指数:

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安装生物信息软件-bowtie2

好吧,这是本周(2016.10.21-28)的学习任务之一:安装bowtie2并学习其使用方法&参数设置 所以,啃文档咯,官方文档Version 2.2.9 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml 以下是我的整理 ...

Sun Oct 23 20:44:00 CST 2016 0 1439
生物信息bowtie比对软件的结果格式说明

生物信息分析中会用到很多的比对软件,比较常用的有bowtie、bowtie2、bwa等,比对文件的标准格式是sam格式,但是bowtie比对默认输出的格式却不是sam格式,由于bowtie适用于短序列比对,并且看突变碱基比较方便,因此它的默认输出格式还是有一定优势的,下面就来说明一下 ...

Fri May 10 21:12:00 CST 2019 0 580
生物信息学在线软件集锦

序列相关 密码子表达优化:Jcat 核酸翻译为蛋白:Translate 序列比对和搜索:NCBI Blast,Uniprot Blast,HMMER,HHblits 序列比对的作图 ...

Wed Sep 02 22:49:00 CST 2020 0 437
生物信息学在线软件集锦

生物信息学分析在线软件集锦 序列相关 密码子表达优化:Jcat 核酸翻译为蛋白:Translate 序列比对和搜索:NCBI Blast,Uniprot Blast,HMMER,HHblits 序列比对的作图 ...

Tue Dec 21 17:47:00 CST 2021 0 103
Homebrew 安装更新软件

brew brew install 安装 brew uninstall 卸载 brew update 更新 homebrew brew upgrade 安装更新软件 brew cleanup 清理 brew cask 安装 cask ...

Thu Apr 04 23:19:00 CST 2019 0 3099
生物信息 perl 脚本实战

索引 1.统计fasta、fa和fastq文件的长度,统计fastq的reads个数,单个reads长度,reads总长度;统计fasta文件中contig的个数,列出名称,单条的长度,以及总长 ...

Fri Aug 12 00:17:00 CST 2016 0 3716
生物信息】RPKM, FPKM和TPM

注:这几个名词是RNA-Seq数据分析中的基础,在此小结一下。 在RNA-Seq的分析中,对基因或转录本的read counts数目进行标准化(normalization)是一个极其重要的步骤 ...

Mon Jul 06 23:38:00 CST 2020 0 6012
 
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