/wiki/metaphlan2 MetaPhlAn2是使用宏基因组鸟枪法测序数据描绘微生物群落组成 ...
以本地电脑wsl子系统的unbantu为例 软件安装 anaconda安装与配置 下载Anaconda . for Linux https: www.anaconda.com download 在下载目录下输入 点yes往下后,输入查看是否安装成功 结果为 更新环境配置 增加源 channels 现在anconda下载好了 .faToTwoBit安装 将fasta格式改为 . bit格式 .安装 ...
2018-12-24 13:54 0 939 推荐指数:
/wiki/metaphlan2 MetaPhlAn2是使用宏基因组鸟枪法测序数据描绘微生物群落组成 ...
好吧,这是本周(2016.10.21-28)的学习任务之一:安装bowtie2并学习其使用方法&参数设置 所以,啃文档咯,官方文档Version 2.2.9 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml 以下是我的整理 ...
生物信息分析中会用到很多的比对软件,比较常用的有bowtie、bowtie2、bwa等,比对文件的标准格式是sam格式,但是bowtie比对默认输出的格式却不是sam格式,由于bowtie适用于短序列比对,并且看突变碱基比较方便,因此它的默认输出格式还是有一定优势的,下面就来说明一下 ...
序列相关 密码子表达优化:Jcat 核酸翻译为蛋白:Translate 序列比对和搜索:NCBI Blast,Uniprot Blast,HMMER,HHblits 序列比对的作图 ...
生物信息学分析在线软件集锦 序列相关 密码子表达优化:Jcat 核酸翻译为蛋白:Translate 序列比对和搜索:NCBI Blast,Uniprot Blast,HMMER,HHblits 序列比对的作图 ...
brew brew install 安装 brew uninstall 卸载 brew update 更新 homebrew brew upgrade 安装已更新软件 brew cleanup 清理 brew cask 安装 cask ...
索引 1.统计fasta、fa和fastq文件的长度,统计fastq的reads个数,单个reads长度,reads总长度;统计fasta文件中contig的个数,列出名称,单条的长度,以及总长 ...
注:这几个名词是RNA-Seq数据分析中的基础,在此小结一下。 在RNA-Seq的分析中,对基因或转录本的read counts数目进行标准化(normalization)是一个极其重要的步骤 ...