amber模拟kcl水溶液
最近刚开始学习amber软件，看网上的教程勉强知道怎么操作这个amber了。就暂时跑了个分子动力学，其他的啥也没处理。先把我的操作过程记录下来吧，免得日后忘记。其实和其他的分子动力学软件的操作大同 ...
原文：VMD-水溶液中注入离子
VMD中默认中性溶液不添加任何离子，故以下操作可加入指定数目的离子。 .建水盒子：VMD Extensions Modeling Add Solvation Box .填写水盒子参数：如下 . 加入离子：完成第二步建成水盒子后，会自动生成solvate.pdb 和solvate.psf文件，有三种加离子方式，后文有对应详解。VMD Main操作：Extensions Modeling Add io ...
2018-12-21 15:28 0 802 推荐指数：
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