RNA-Seq分析——KEGG富集分析
入学到现在已经有小半年了，最近正好在做RNA-Seq的分析，记录一下自己的成长轨迹。 以下是我用clusterProfiler对拟南芥的差异表达基因做的kegg富集分析： # 载入需要的R包 library(clusterProfiler) # 载入我用edgeR得到的差异表达 ...
原文：RNA-seq(9):功能富集分析
这部分开始进行基本的富集分析，两类 A：差异基因富集分析 不需要表达值，只需要gene name B: 基因集 gene set 富集分析 不管有无差异，需要全部genes表达值 A：差异基因富集分析 不需要表达值，只需要gene name 先说富集什么 最常用的基因注释工具是GO和KEGG注释，这基本上是差异基因分析一定做的两件事。GO可以在GO:BP 生物过程 ，GO:MF 分子功能 ，GO ...
2018-12-15 11:18 0 1543 推荐指数：
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