Linux中fasta文件的拆分与合并 FASTA文件的拆分: (1)如果从一个文件a提取第11至20个序列存到另一个文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print "> ...
合并并转化一代测序seq纯文本为fasta格式文件 合并文件夹下的纯文本文件 批量序列拼接 use strict use warnings open T, lt T a.fas open R, lt R a.fas open H, gt Haplotypes.fas my t lt T gt my r lt R gt sub combine print H gt n my tag foreach ...
2018-11-13 11:01 0 788 推荐指数:
Linux中fasta文件的拆分与合并 FASTA文件的拆分: (1)如果从一个文件a提取第11至20个序列存到另一个文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print "> ...
split :可以将一个大文件分割成多个小文件,有时候需要将问卷分割成更小的片段,比如提高可读性,生成日志。 语法: split [OPTION]... [INPUT [PREFIX]] Output fixed-size pieces of INPUT to PREFIXaa ...
前言 ofd文件拆分合并会在多个场合用到,但市面上此类工具并不多。拆分和合并虽然为两个功能,但从编程角度考虑,其处理思路有相同之处。文章就以合并为例,讲一下处理思路。作者也写了一个拆分合并小工具(加入qq群618168615下载),欢迎使用。 程序界面如下: 具有的功能:ofd合并 ...
一、Split 和 Select (使用split切分过的流是不能被二次切分的) DataStream --> SplitStream : 根据特征把一个DataSteam 拆分成两个或者多个DataStream. SplitStream --> ...
代码演示 横向合并: 运行结果: 代码演示 纵向合并: 原文:https://blog.csdn.net/qq_35415600/article/details/70237433 ...
-- 1.splitByChar(separator, s) 将字符串以‘separator’拆分成多个子串。 -- 2.splitByString(separator, s) -- 3.alphaTokens(s) 从范围a-z和A-Z中选择连续字节 ...
使用Perl合并文件 有时需要将整个目录下的小文件合并到一个文件中,以便查阅检索 特性 整个目录完全遍历,自动存入单个文件 顺序遍历文件 待合并的目录 合并后的文件内容 Perl代码 ...
一、关于程序: FUN:计算FASTA文件中每条序列中G和C的含量百分比,输出最大值及其id INPUT:FASTA格式文件 >seq1 CGCCGAGCGCTTGACCTCCAGCAAGACGCCGTCTGGCACATGCAACGAGCTGTAGCAGAC >seq2 ...