RNA-seq表达数据之样本PCA分析
Principal component analysis (PCA) 分析 主成分分析(PCA)帮助我们归纳总结和可视化数据集中的信息，这些数据包含由多个相互关联的变量描述的个体 / 观察主成分分析。 可以将每个变量视为不同的维度。 但如果您的数据集中有3个以上的变量，那么很难在多维超空间可视化 ...
原文：RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析
RNA seq中的基因表达量计算和表达差异分析 差异分析的步骤： 比对 read count计算 read count的归一化 差异表达分析 背景知识： 比对：普通比对： BWA，SOAP开大GAP比对：Tophat Bowtie Read count 多重比对的问题 ：丢弃平均分配利用Unique region估计并重新分配表达量计算的本质目标基因表达量相对参照系表达量的数值。参照的本质： 假设 ...
2018-11-13 10:50 0 5028 推荐指数：
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零基础照样做RNA-seq差异分析 GCBI知识库2018-08-24 14:43:36 基因表达谱的差异分析是RNA-seq中最常见的应用。你眼中的RNA-seq差异分析或许是酱紫的，对不会编程，不懂统计，纯正生物学出生的人， 内心简直SOS…… 但有些人眼中 ...
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