原文:RNA提取和建库流程对mRNA-Seq的影响

RNA提取和建库流程对mRNA Seq的影响 已有 次阅读 : 个人分类:转录组测序 系统分类:科研笔记 关键词:转录组测序,RNA Seq,,链特异性RNA Seq,转录组文库构建,总RNA提取 RNA seq,转录组测序,链特异性RNA Seq,转录组文库构建,总RNA提取 目前RNA Seq是挖掘不同生长时期及不同胁迫条件下 不同组织细胞中其差异表达基因通常所采用的研究方法,同时还可以鉴定 ...

2018-11-10 16:08 0 1580 推荐指数:

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RNA-seq技术 | RNA sequence library construction

为什么必须了解技术? 转录组有哪些分类? 有哪些常见的RNA-seq技术?各有什么特点 活体真核细胞里有哪些RNA,各自有什么功能,占比多少? PCR对RNA-seq影响?PCR free是什么意思? 为什么RNA-seq总有一部分reads无法比对到转录组? RNA-seq ...

Sun Jul 05 02:38:00 CST 2020 0 1728
RNA-seq简单处理流程

RNA_seq pipline RNA_seq pipline PeRl 2018年3月7日 首先说明一下我做RNA-seq处理流程的文件树格式: RNA-seq/ data ...

Sun Mar 11 02:27:00 CST 2018 0 2961
Seq数据分析流程RNA

文章目录 RNA-seq 数据分析流程 相关软件安装 下载数据 sra转fastq格式 数据质控 数据质控,过滤低质量reads,去接头 比对 ...

Wed Jul 07 02:14:00 CST 2021 0 216
RNA-seq 基本分析流程

高通量测序技术,就是二代测序,已经成为现代生物学研究的一个较为常规的实验手段。这一技术的发展极大地推动了基因组学,表观基因组学以及翻译组学的研究。RNA-seq 通过测定稳定状态下的RNA样品的序列来对RNA样品进行研究,从而避免了许多之前研究手段的不足,比如象基因芯片或者 PCR 就需要背景知识 ...

Wed Feb 27 02:20:00 CST 2013 2 14247
ChIP-seq | ATAC-seq | RNA-seq | 数据分析流程

补充RNA-seq流程 以前都是自己搭RNA-seq流程,虽然可以完成任务,但是数据量一多,批次多起来,就非常难管理。 既然别人提供了这么好的流程,那就要用起来,管理起来不是一般的轻松。 ENCODE-DCC/rna-seq-pipeline 安装比较麻烦,没有针对local的一键安装 ...

Tue Dec 10 17:57:00 CST 2019 0 1272
上传RNA-seq数据到NCBI GEO数据 | 单细胞RNA数据上传

SRA - NCBI example - NCBI 要发文章了,审稿时编辑肯定会要求你上传NGS测序数据。 一般数据都是放在集群,不可能放在个人电脑上,因为有的数据大的吓人(几个T)。 所以我们就一个文件夹,然后把所有需要的fastq文件链接到这个文件夹就行了(copy太慢,也太占空间 ...

Wed May 30 00:58:00 CST 2018 0 6106
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing)

什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现,转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况,主要分为两类,一类是基于杂交,一类是基于下一代测序技术 ...

Fri Oct 19 05:42:00 CST 2018 0 2871
上传RNA-seq数据到NCBI GEO数据 | 单细胞RNA数据上传

上传RNA-seq数据到NCBI GEO数据 | 单细胞RNA数据上传 SRA - NCBI example - NCBI 要发文章了,审稿时编辑肯定会要求你上传NGS测序数据。 一般数据都是放在集群,不可能放在个人电脑上,因为有的数据大的吓人 ...

Tue May 26 21:44:00 CST 2020 0 1220
 
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