原文:使用Trinity拼接以及分析差异表达一个小例子

使用Trinity拼接以及分析差异表达一个小例子 : : Trinity 将测序数据分为许多独立的de Brujin graph,理论上每一个图对应一个表达的基因。 整个流程分为三个步骤:Inchworm, Chrysalis, and Butterfly Inchworm:从reads中提取所有的重叠k mers,根据丰度递减的顺序检查每个k mers,然后将重叠的k mers延长到不能再延长 ...

2018-11-09 22:21 0 1899 推荐指数:

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Ballgown是分析转录组差异表达的R包。 软件安装: 运行R, source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”) biocLite(“ballgown”) R会自动安装Ballgown,及相应的依赖包。 Ballgown的输入文件 ...

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