总结起来就三句话： （1）当同一个数据集有n次（n>=2）假设检验时，要做多重假设检验校正 （2）对于Bonferroni校正，是将p-value的cutoff除以n做校正，这样差异基因筛选的p-value cutoff就更小了，从而使得结果更加严谨 （3）FDR校正是对每个 ...

RNA-seq数据分析中，为了鉴定两个group 差异表达的基因，会针对每一个基因分别做假设检验（例如T-test），这里会出来一个P-value，但是往往R中专门做差异表达的package，还会有Adjusted-P 这么一个P-value。或者我们经常会碰到FDR这个概念。这些说的都是 ...

一、假设检验 假设检验的基本思路是： 设立零假设（null hypothesis）H0，以及与零假设H0相对应的非零假设（alternative hypothesis）H1，在假设H0成立的前提下，计算出H0发生的概率，若H0的发生概率很低，基于小概率事件几乎不可能发生，所以可以拒绝零假设 ...

http://home.52brain.com/forum.php?mod=viewthread&tid=27066&page=1#pid170857 http://www.math ...

来源： http://blog.sciencenet.cn/blog-479412-572049.html，http://52brain.com/thread-15512-1-1.html SPM8允许两种FDR校验。一个是voxel-wise FDR，另一个是topological ...

1.Bonferroni校正：用0.05除去多重比较的数目，得到一个比较低的阈限。（苛刻，只在数目比较少时用） 2.错误发现率（False Discovery Rate，FDR）校正：将所有样本（voxel）的p值进行从小到大排序，找到第n个p值超过n*0.05/N。如果样本里p值低的voxel ...

matlab自带函数mafdr，当ttest数较多时，可直接用[FDR, Q]=mafdr(P)；但是Storey procedure在p值少于1000个时会崩溃，此时应改用BH FDR方法：mafdr(P,'BHFDR', true)。该方法对于少量ttest更稳健，但是更保守。 参考 ...

来源：http://blog.sina.com.cn/s/blog_6b1c9ed50101l02a.html，http://wenku.baidu.com/link?url=3mRTbARl0uPH ...