原文:使用limma、Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌

使用limma Glimma和edgeR,RNA seq数据分析易如反掌 Charity Law , Monther Alhamdoosh , Shian Su , Xueyi Dong , Luyi Tian , Gordon K. Smyth and Matthew E. Ritchie The Walter and Eliza Hall Institute of Medical Resea ...

2018-11-09 20:36 0 5563 推荐指数:

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ChIP-seq | ATAC-seq | RNA-seq | 数据分析流程

补充RNA-seq流程 以前都是自己搭RNA-seq流程,虽然可以完成任务,但是数据量一多,批次多起来,就非常难管理。 既然别人提供了这么好的流程,那就要用起来,管理起来不是一般的轻松。 ENCODE-DCC/rna-seq-pipeline 安装比较麻烦,没有针对local的一键安装 ...

Tue Dec 10 17:57:00 CST 2019 0 1272
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RNA-seq 数据的简单分析

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RNA-seq表达数据之样本PCA分析

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RNA-seq分析htseq-count的使用

HTSeq作为一款可以处理高通量数据的python包,由Simon Anders, Paul Theodor Pyl, Wolfgang Huber等人携手推出HTSeq — A Python framework to work with high-throughput sequencing ...

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RNA-seq(9):功能富集分析

这部分开始进行基本的富集分析,两类 A:差异基因富集分析(不需要表达值,只需要gene name) B: 基因集(gene set)富集分析(不管有无差异,需要全部genes表达值 ...

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