原文:K-mer分析

.基本参数 基因组大小:G Read读长:L 总Read条数:n r .碱基深度分布 单条Read测序覆盖到某一个碱基的概率:L G 因为L G很小,n r很大,每个碱基覆盖深度服从泊松分布。 则每个碱基的覆盖深度的期望为:d n L G n r . K mer深度分布 假设基因组对K是unique的,可以得到G个不同的K mer。 单条Read测序覆盖某个K mer的概率: L K G 同样因 ...

2018-11-03 01:52 0 2392 推荐指数:

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