官网 源码 安装&使用 BWA http://bio-bwa.sourceforge.net/ ht ...
.SOAPDenovo配置文件示例 软件下载安装和使用:http: soap.genomics.org.cn soapdenovo.html asm.cfg 运行脚本: run.sh . VCFtools的使用 软件下载和使用: https: vcftools.github.io documentation.html https: vcftools.github.io man latest.ht ...
2018-11-02 21:48 0 671 推荐指数:
官网 源码 安装&使用 BWA http://bio-bwa.sourceforge.net/ ht ...
在生信公司里,有相当一部分人都是负责编写流程和维护流程。 流程pipeline,就是让用户(前端)在填写配置文件后能够一键运行的脚本,最终自动得出结果,并生成报告,有的公司还会将结果上传。 自动化pipeline必须具备的功能: 读取配置文件,生成相应的待执行的脚本 按照先后 ...
,可以快速、批量、灵活的处理数据的提取、统计和整理等耗时耗力的重复性工作。日常生信分析中,多数整理工作 ...
这是一个尝试性的文章,能不能解决我要解决的问题,并不清楚。 ===本文利用NCBI的blast界面,实现将短序列比对上reference基因组,并实现变异位点可视化。===补言=== 比对常用的是NCBI网站,打开NCBI。(百度 谷歌直接搜索NCBI, 现在中国也在搭建和完善国家生物信息中心 ...
非原创 参考资料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写,GO数据库分别从功能、参与的生物途径及细胞 ...
在利用jmeter进行接口测试或者性能测试的时候,我们需要处理一些复杂的请求,此时就需要利用beanshell脚本了,BeanShell是一种完全符合Java语法规范的脚本语言,并且又拥有自己的一些语法和方法,所以它和java是可以无缝衔接的。beanshell由于内置了一些特有的变量,没法在一些 ...
来自:中国大学mooc-山东大学 生物信息学 课程 1.什么是序列? 序列就是字符串。 s就是一个序列。(原来序列是这么简单的,听着太高大上了) 蛋白质序列:由20个不同的字母(氨基酸)排 ...
近期面试的生信工程师。 福建农林大学的生物信息硕士毕业,在某基因检测大厂下的一家福州子公司做生信研发。 读书期间做农口,毕业两年一直做医口,非交付岗位,属于与医院合作发文的形式。主要是利用一些经典机器学习方法筛选疾病标志物。 优点是编程基础尚可,能用机器学习做一些分析,技术原理掌握的也还行 ...