unique reads:在参考组上只有一个匹配点 multi-mapping reads:在参考组上有多个匹配点 下面是tophat的一个结果案例: the quantity of unique reads :25159791-1027691= the quantity ...
.NGS中的reads mapping 顾名思义,就是将测序的得到的DNA定位在基因组上。 因为二代测序的得到的序列是较短的,reads mapping很好地解决了这个问题。 本质上reads mapping是一个双序列比对问题,但和之前讲的NW和SW的不一样,后者适用于两者长度相差不大的。 现在问题有几个特征: .reads和ref的长度有着跨数量级的差异,reads长度通常不超过 bp,而r ...
2018-10-20 11:13 0 1045 推荐指数:
unique reads:在参考组上只有一个匹配点 multi-mapping reads:在参考组上有多个匹配点 下面是tophat的一个结果案例: the quantity of unique reads :25159791-1027691= the quantity ...
前言 我的本科是读的电子信息工程,研究生跟着老师做项目,参与到深度学习中来,毕业后做了算法工程师,工作之后愈发发现,不论从事什么岗位,基础都很重要,但现在也没有时间再读一遍本科了,自学的话也不知道从何学起,就产生我为什么不试着自学大学里面CS专业课程的念头。我自认为自己算是孜孜不倦的,用学习 ...
公号:码农充电站pro 主页:https://codeshellme.github.io 1,ES 中的 Mapping ES 中的 Mapping 相当于传统数据库中的表定义,它有以下作用: 定义索引中的字段的名字。 定义索引中的字段的类型,比如字符串,数字 ...
默认mapping ES能非常聪明的识别出"name"和"description"字段的类型是string, ES默认会创建以下的mapping。 mapping参数 字段中的type(es数据类型) ...
映射(Mapping) 概念:创建索引时,可以预先定义字段的类型以及相关属性。从而使得索引建立得更加细致和完善。如果不预先设置映射,会自动识别输入的字段类型。 官方文档(字段数据类型):https://www.elastic.co/guide/en/elasticsearch ...
(1)往es里面直接插入数据,es会自动建立索引,同时建立type以及对应的mapping (2)mapping中就自动定义了每个field的数据类型 (3)不同的数据类型(比如说text和date),可能有的是exact value,有的是full text (4)exact value ...
高通量测序数据分析: 高通量测序中,reads、contigs、scaffold、unigene、singleton各是什么,有什么关系? 1. 什么是read? 高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序;就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代 ...
官网 源码 安装&使用 BWA http://bio-bwa.sourceforge.net/ ht ...