原文:TPM、read counts、RPKM/FPKM你选对了吗?

TPM read counts RPKM FPKM你选对了吗 已有 次阅读 : 个人分类:RNA seq 系统分类:科普集锦 关键词:RNA seq RNA seq 本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow genome 作者:小哈 来源:嘉因 在RNA测序分析,哪家公司适合我一文中,聊过类似的问题。 这次小哈搬来了statQuest的 个最新视 ...

2018-10-18 21:37 0 1316 推荐指数:

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FPKM/RPKM以及TPM的理解

FPKM/RPKM以及TPM的理解 2018年07月03日 16:05:53 sixu_9days 阅读数:559 标签: FPKM/RPKMTPMRNA-Seq 更多 个人分类: RNA-Seq ...

Thu Oct 18 18:49:00 CST 2018 0 949
【生物信息】RPKM, FPKMTPM

注:这几个名词是RNA-Seq数据分析中的基础,在此小结一下。 在RNA-Seq的分析中,对基因或转录本的read counts数目进行标准化(normalization)是一个极其重要的步骤,因为落在一个基因区域內的read counts数目取决于基因长度和测序深度。很容易理解:一个基因 ...

Mon Jul 06 23:38:00 CST 2020 0 6012
RNA-Seq分析|RPKM, FPKM, TPM, 计算对比

在分析了若干转录组之后发现,处理数据的时候最重要的不是技巧多么绚丽,你调包的能力有多么强。而是把基本的概念特别是统计和数学上的方法咬烂嚼吐,才是真正理解和掌握了分析数据的底层原理: 在RNA-Seq的分析中,对基因或转录本的read counts数目进行normalization是一个 ...

Fri Jul 06 05:50:00 CST 2018 0 914
转录组表达量计RPKMFPKMTPM说明

在转录组测序(RNA-Seq)中,基因的表达量是我们关注的重点。基因表达量的衡量指标有:RPKMFPKMTPMRPKM:Reads Per Kilobase Million;说实话,这个英文说明真的很费解,其实可以理解为“Reads Per Kilobase Per Million ...

Sat Apr 28 06:03:00 CST 2018 0 31657
基因表达量表示方法 RPKM VS FPKM VS TPM

之前不是很理解这两个概念,看了本文之后就差不多理解了。 基因组学技术专题(二):为什么说FPKM/RPKM是错的 转自:安诺基因 我们都知道RNA-seq是通过NGS技术来检测基因表达量的测序方法。在衡量基因表达量方面,若是单纯以比对到参考基因的Reads个数(我们通常称之为Count值 ...

Thu Feb 16 00:24:00 CST 2017 0 1485
初学编程,选C还是选C++,你选对了吗

如果手头有一个强大的C ++编译器,切勿使用C。 如果需要,可以使用禁止C ++的所有功能的编码约定,包括标准C ++库,异常,RTTI以及C ++符号修饰。 但是,C ++具有许多可以编写代码的 ...

Sun Sep 20 03:36:00 CST 2020 0 625
开源API网关,你选对了么?

开源API网关,你选对了么? api网关的本质 不用扯那么多,也不用画图,一句话说清楚 api网关:流量总入口,得以集中控制! 就这么简单 api网关协议上最基本要支持HTTP 和 WebSocket,功能强大点的更会支持tcp/udp的负载均衡接入 正因为支持的是http协议,所以api ...

Fri Jan 10 06:52:00 CST 2020 1 5031
 
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