链特异性转录组测序 非链特异性转录组测序信息不包含链方向的特征信息,对正义和反义转录本无法准确判断,导致无法反映真实的转录情况。而链特异性转录组测序(strand-specific RNA seq)可以解决这个问题。链特异性建库的方式是在合成cDNA的第二条链时 ...
对链特异性建库的理解 年 月 日 : : sixu days阅读数: 标签:链特异性建库LncRNA seq更多 个人分类:RNA Seq 刚接触高通量测序的时候就知道有链特异性建库这么个概念,当时也了解可以利用加U法,但是没有思考其中的细节。最近把这个概念掰开了揉碎了好好理解,终于填上了这个坑。 正式讲之前,有几个概念是要明确的。 DNA 的正链和负链,就是那两条反向互补的链。参考基因组给出的 ...
2018-10-18 10:50 0 1265 推荐指数:
链特异性转录组测序 非链特异性转录组测序信息不包含链方向的特征信息,对正义和反义转录本无法准确判断,导致无法反映真实的转录情况。而链特异性转录组测序(strand-specific RNA seq)可以解决这个问题。链特异性建库的方式是在合成cDNA的第二条链时 ...
参考文献:http://www.jianshu.com/p/a63595a41bed http://kaopubear.top/categories/ ...
众所周知,全基因组关联分析(GWAS)发现的很多变异位点基本为非编码,这些变异位点1)要么调控基因表达(eQTL); 2)要么影响增强子活性; 3)要么影响转录因子(TF)结合特异性; 4)要么啥也不是。 针对以上四种情况: 1)是否调控基因表达(eQTL)可通过GTEx(https ...
https://blog.csdn.net/dgyuanshaofeng/article/details/78686117 Sensitivity,我们常说“敏感性”、“灵敏性”、“召回率”或者“查 ...
(Sen): Sen=TP/(TP+FN)*100% 特异性 Specificity (Spe) s ...
二、下载对比数据库 下载地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast ...
位点特异性重组 和 DNA转座 视频 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition J.D. Watson et. al 很多重要DNA重排是由两类重要遗传 ...
目录 1. 主要参考文献 1) 综述 2)研究和方法 水稻PNAS——张启发、刑锋 棉花NC——胡冠菁、包颖 ...