原文:Shell字符串截取处理文件路径

在生信处理流程中,从最初的fastq文件,经过分析处理后,会生成一堆的后续文件,如何在流程中合理的命名呢 通常在批处理模式中,我们会得到多个样本 .fastq 或 .fq .fastq.gz .fq.gz 路径名文件sample.txt。如下所示: 上述,是一个多个双端 .fastq全路径文件sample.txt的内容,我们只需写好一个样本的分析流程,然后嵌套while循环,就可以实现批处理了。 ...

2018-09-17 18:56 0 1385 推荐指数:

查看详情

Shell字符串截取

1、从指定位置开始截取 这种方式需要两个参数: 1.起始位置 2.截取长度既然需要指定起始位置,那么就涉及到计数方向的问题,到底是从字符串左边开始计数,还是从字符串右边开始计数,答案是shell同时支持两种计数方式 1.1 从字符串左边开始计数 从左边开始计数,截取字符串的格式 ...

Tue Sep 17 17:13:00 CST 2019 0 1617
shell字符串截取

shell字符串截取的问题: 一、Linux shell 截取字符变量的前8位,有方法如下:   1.expr substr “$a” 1 8   2.echo $a|awk ‘{print substr(,1,8)}’   3.echo $a|cut -c1-8   4.expr ...

Fri Aug 31 18:12:00 CST 2012 0 36218
shell 字符串处理(截取,连接,匹配,替换,翻转)

shell 字符串处理(截取,连接,匹配,替换,翻转) http://www.ahlinux.com/shell/5761.html 本节分享下,shell字符串处理的内容,包括:截取,连接,匹配,替换,翻转等。 1,字符串截取方法一: 代码示例:echo $a|awk ...

Sat Oct 03 07:52:00 CST 2015 0 2064
Shell 截取字符串

转载自:https://www.cnblogs.com/fengbohello/p/5954895.html (作者:郝峰波 Linux Shell 截取字符串) 下文原创作者郝峰波,内容以及足够详细,我平常也经常参考,在此直接引用。 shell截取字符串的方法 ...

Sat Jun 08 07:12:00 CST 2019 0 15896
Linux Shell 截取字符串

shell截取字符串的方法很多 下面用几个例子展示一下: 1) 获得字符串的长度 语法: 示例代码: 执行结果: 2) 使用 # 和 ## 获取尾部子字符串 ...

Mon Aug 19 18:19:00 CST 2019 0 421
shell截取字符串的方法

shell截取字符串的方法有很多中,${expression}一共有9种使用方法。${parameter:-word}${parameter:=word}${parameter:?word}${parameter:+word} 上面4种可以用来进行缺省值的替换。${#parameter}上面这种 ...

Thu Mar 14 17:40:00 CST 2019 0 3714
shell 截取变量的字符串(转)

来自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_7c95e5850100zpch.html 假设有变量 var=http://www.linuxidc.com/test.htm 一 # 号截取,删除左边字符,保留右边字符 ...

Mon Jan 05 02:45:00 CST 2015 0 5002
Linux shell字符串截取与拼接

一 Linux 的字符串截取很有用。有八种方法。 假设有变量 var=http://www.linuxidc.com/123.htm 1 # 号截取,删除左边字符,保留右边字符。 echo ${var#*//} 其中 var 是变量名,# 号是运算符,*// 表示从左边开始删除第一个 ...

Tue Oct 10 03:29:00 CST 2017 0 61304
 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM