org.Hs.eg.db安装成功,但加载时失败: 先运行options(connectionObserver = NULL)命令,后继续加载此包可成功 ...
安装载入 if org.Hs.eg.db in rownames installed.packages FALSE source http: bioconductor.org biocLite.R biocLite org.Hs.eg.db suppressMessages library org.Hs.eg.db 查看该包所有的对象 ls package:org.Hs.eg.db 功能:可以用 ...
2018-09-09 10:15 0 1873 推荐指数:
org.Hs.eg.db安装成功,但加载时失败: 先运行options(connectionObserver = NULL)命令,后继续加载此包可成功 ...
.html (在org.Hs.eg.db导入前需要导入一些其它的包,按要求导入就行) 二,查看org.Hs.eg.db里面的数据类 ...
Ensemble ID Ensemble ID 是Ensembl 数据库使用的ID标识符,用于标识不同的分子特征,如基因,转录本,外显子,蛋白。大多数据库都有一套自己的ID命名。ID 主要是为消除歧义,在特征注释或数据库更新时也能保持一致。不像人为命名的分子名字,如基因名字那样可能发生改变 ...
1、安装"biomaRt"包 2、"ensembl_transcript_id_version" 转 "refseq_mrna", "ensembl_gene_id", "hgnc_symbol" 输入文件file.txt如下所示: 转换命令如下: 输出文件new如下所示: ...
经过几次尝试最终找到解决的办法,因为网上并没有详细说明,所以下面我将详细的步骤记录如下: 1. 大前提是你已经安装好DB2服务器和mySQL服务器,现在只是借用Navicat for MySQL这个软件把DB2中的数据库转换到mySQL中去。 2. 首先利用这个软件建立一个连接 ...
DAVID网站提供了id转换的功能 1 选择上传gene list文件 2 选择上传ID的类型,我们ID-list.txt中的是Ensembl Gene ID,所以这里选ENSEMBL_GENE_ID 3 这个是类型,因为只做ID转换,所以选Gene ...
1.bioMart包的介绍 bioMart包是一个连接bioMart数据库的R语言接口,能通过这个软件包自由连接到bioMart数据库,这个包可以做以下几个工作: 1.查找某个基因在染色体上的位置。反之,给定染色体每一区间,返回该区间的基因; 2.通过EntrezGene的ID ...
简介 SRA数据库是美国国立卫生研究院(NIH)的高通量测序数据的主要归档,是国际核苷酸序列数据库协作(INSDC)的一部分,其中包括NCBI序列读取存档(SRA),欧洲生物信息学研究所(EBI)和DNA数据库 日本(DDBJ)。 提交给三个组织中的任何一个的数据都是共享的。 SRA ...