之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out format。 常见的网页版blast结果可以参照:Blast结果的详细解析 ...
blast产生背景 双序列比对可以采用是基于动态规划算法的Needleman Wunsch NW 和Smith Waterman algorithm SW 算法,虽然精度高,但计算消耗大。当与数据库比对的时候,该算法就显得不切实际。因此TASTA,blast采用启发式算法使得通过大幅度丢失灵敏度来减少运行时间。与FASTA软件相比,blast通过把搜索限制在狭隘的矩阵对角线条带上,来改进FAST ...
2018-08-21 11:54 0 1501 推荐指数:
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最开始使用Matplotlib,一是因为它不需要像Matlab一样花很长时间启动一个图形界面,二是它可以直接保存为.eps格式。在图像显示出来之后,在左下角有几个按钮,最后一个就是保存,在保存的对话框选择.eps格式即可。另一种方式就是在程序里面使用pyplot.savefig(name ...
C++ 可通过流的概念进行程序与外界环境( 用户、文件等 )之间的交互。流是一种将数据自源( source )推送至目的地( destination )的管道。在 C++ 中,与标准输入/输出相关的流可通过头文件 <iostream> 使用,与文件读写相关的流可以通过头文件 < ...
blast的原理就是将想要明确注释的sequence(这个sequence就是query)先打断,即一条sequence变成多条sub-sequence(sub-sequence也就是word),然后拿这些sub-sequence与数据库中的序列比较(数据库中的序列是已经注释 ...
Hex格式和Mot格式简介 一、Hex格式介绍 1.1 什么是 Intel HEX 文件格式? Intel HEX文件 是由一行行符合 Intel HEX文件格式的文本所构成的ASCII文本文件。 在Intel ...
一、yaml简介 yaml是一种用来写配置文件的序列化语言,跟json有些像,yaml又称作json的超集,yaml的设计则是为了友好可读性,主要用于配置信息的书写,而json设计的目的则是为了简单和通用,主要用于存储数据和应用层数据通信使用。 二、格式 yaml主要有三种类型的数据 ...
Cube.obj mtllib cube.mtl g default v -0.500000 -0.500000 0.500000 v 0.500000 -0.500000 0.500000 v - ...
数据结构、各种设定档、倾印除错内容、文件大纲(例如:许多电子邮件标题格式和YAML非常接近)。 尽管它 ...