gff/gtf格式
1）gff3及gtf2简介 一个物种的基因组测序完成后，需要对这些数据进行解读，首先要先找到这些序列中转录起始位点、基因、外显子、内含子等组成元件在染色体中的位置信息(即注释)后才能再进行深入的分析。gff/gtf是贮存这些注释信息的两种文件格式。 GFF(general feature ...
原文：GTF/GFF文件的差异及其相互转换
我们在做生物分析的时候，经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件。他们有着相似的名字，甚至连内容都极为相似 那么，他们究竟差在哪里呢 GFF全称为general feature format，这种格式主要是用来注释基因组。 GTF全称为gene transfer format，主要是用来对基因进行注释。 数据结构 GTF文件以及GFF文件都由 列数据组成，这两种文件的前 列都是相同的 ...
2018-07-25 17:34 0 2059 推荐指数：
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工具推荐：https://github.com/openvax/gtfparse 真不敢相信，Linux自带的命令会这么强大，从gtf中提取出需要的transcript，看起来复杂，其实一个grep就搞定了。 grep -F -f out.list gffcmp.combined.gtf ...
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