NCBI下载SRA数据
从NCBI下载数据本来是一件很简单的事情，但是今天碰到几个坑： 1、paper里没有提供SRA数据号、也没有提供路径； 2、不知道文件在ftp的地址，不能直接用wget下载 所以通过在NCBI官网，直接在SRA搜索栏里： 输入paper的title关键词NIFTY BGI ...
原文：【只要有ENA千万别用NCBI】拆分SRA文件，通过SRAtoolkits
只要有ENA千万别用NCBI 最近开始分析网上Download的数据，一开始用人家现成的GWAS数据，后来觉得反正自己的数据到手该做的也是要做的，出来混早晚是要还的，所以就开始从头分析一些SRA的数据，我以为会很简单，事实证明是我简单了。 首先我们下了这样的一串数据， .sra格式： 这些数据需要把他们变成fastq格式我们才好下手，这些数据是双端有 ，也有 bp的重测序，也就是说这里的数据是被称 ...
2018-07-13 12:30 0 1083 推荐指数：
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