原文:将vcf文件转化为plink格式并且保持phasing状态

VCFtools can convert VCF files into formats convenient for use in other programs. One such example is the ability to convert into PLINK format. The following function will output the variants in.pedan ...

2018-07-08 14:31 0 1539 推荐指数:

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plink格式文件转化为vcf文件VCF versions convert)

plink1.9版本支持转化为VCFv4.2格式 plink2.0版本支持转化为VCFv4.3格式 两个版本用到的命令不一样 对于plink1.9版本,转化为vcf文件的命令行为: 生成的vcf为4.2版本 对于plink2.0版本,转化为vcf文件的命令行 ...

Fri Mar 16 00:17:00 CST 2018 0 3147
vcf格式文件转化为Excel(csv)格式文件(R语言的write.csv,write.table功能,Excel表的文件导入功能)

最近在整理文件,准备把vcf文件转化为Excel格式,或者CSV格式,网上搜了一堆资料,还真有人专门开发出转化格式的工具:叫vcf2csv(下载地址http://vcf2csv.sourceforge.net/#links),赶紧下载安装,开始转化,结果弹出行列不一致的错误,遂放弃。 尝试了一堆 ...

Tue Aug 15 00:12:00 CST 2017 0 2371
python实现将android手机通讯录vcf文件转化为csv

经常会遇到将手机通讯录导出到电脑并转化为在电脑中可编辑的情况,在网上搜索了很久当前不外乎两种处理方式。1.使用电脑的outlook的通讯簿功能,将手机导出的vcf文件导入到outlook的通讯录中,然后再导出为可编辑文件;2.是使用专用软件直接打开vcf文件。很不幸两种都不适合我,第一种导出 ...

Mon Mar 25 04:35:00 CST 2019 0 843
使用plink将基因型转化为0,1,2

如果想将基因型转化为0,1,2 可以使用命令:plink --bfile file --recodeA --out recodefile 如果想将基因型转化为0,1 可以使用命令:plink --bfile file --recodeD --out recodefile 如果想将基因型同时转化为 ...

Wed Jul 08 23:57:00 CST 2020 0 964
通过Matlab将Raw格式文件转化为Bmp格式图片

在处理Raw格式文件转变为Bmp格式的图片时,一般要预先得知图片的大小,在这里采用的是512*512大小,下面是一段Matlab实现的Raw2Bmp的代码。 需要将Raw格式文件放在和Matlab的.m文件的同一个文件夹内。 ...

Wed Mar 18 08:11:00 CST 2020 0 929
用vba把excel文件发布转化为pdf格式文件

将工作薄每一个工作表导出为PDF文件。   将当前工作表导出为PDF文件。 VBA 参考文档 https://msdn.microsoft.com/zh-cn/VBA/Excel-VBA/articles ...

Tue Sep 11 04:35:00 CST 2018 0 2307
 
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