转录组（八）：差异基因注释
引入clusterProfiler与注释数据 GO(gene ontology)分析 GO，Gene Ontology，是基因功能国际标准分类体系。它旨在建立一个适用于各种物种的，对基因和蛋白质功能进行限定和描述的，并能随着研究不断深入而更新的语言词汇标准。GO分为分子功能 ...
原文：【转录组入门】8：差异基因结果注释
作业要求： 我们统一选择p lt . 而且abs logFC 大于一个与众的基因为显著差异表达基因集，对这个基因集用R包做KEGG GO超几何分布检验分析。 然后把表达矩阵和分组信息分别作出cls和gct文件，导入到GSEA软件分析。 基本任务是完成这个分析。 环境准备 gene id 转换 GO富集分析必须要用ENTREZID 最常见的是ENSEMBL，ENTREZID两大类。 ENTREZID ...
2018-07-03 21:56 0 1082 推荐指数：
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