edgeR的使用
edgeR包是进行RNA-seq数据分析非常常用的一个R包。该包需要输入每个基因关于每个样本的reads数的数据，每行对应一个基因，每一列对应一个样本。 安装edgeR 先启动R，然后运行下面代码：if (!requireNamespace("BiocManager", quietly ...
原文：edgeR 包的使用
edgeR包是进行RNA seq数据分析非常常用的一个R包。该包需要输入每个基因关于每个样本的reads数的数据，每行对应一个基因，每一列对应一个样本。建议使用htseq count进行统计，输出文件即可直接使用。如果需要算RPKM，需要自己统计基因长度信息。 第一步：构建 DGEList类变量 edgeR的大多数操作都是对 DGEList类型变量进行，所以第一步必须构建该类型变量，使用函数：D ...
2018-06-18 10:39 0 2507 推荐指数：
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