做差异表达的软件DEseq和edgeR所需要的数据格式必须是原始counts,经过normalization和log2后的数据都不适合，所以对于做差异表达计算的童鞋可以使用ExperimentHub下载TCGA的原始数据。 GEO地址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

中国大牛力作 张泽民： http://gepia.cancer-pku.cn/index.html http://cancer-pku.cn/ ...

最出名，http://www.cbioportal.org/ 特色：最基本的简单分析基因突变、共表达/共突变的基因，下载数据也可以，最常看的应该还是oncoPrint那个。 详细用法：TCGA数据库的数据怎么查？ 最方便，Ge-mini 特色：手机app，可随时查看，主要关注基因表达 ...

前言 本文主要演示GEO数据库的一些工具，使用的数据是2015年在Nature Communications上发表的文章Regulation of autophagy and the ubiquitin-proteasome system by the FoxO transcriptional ...

RNA-seq 测序可以用于融合基因的发现，在过去的十几年里，RNA-seq 测序数据不断增加，发现的融合基因的数据也不断增加； FusionCancer 是一个人类癌症相关的融合基因的数据库，利用NCBI SRA数据库中的RNA-seq 数据，采用tophat-fusion ...

TCGA数据库 是 生物信息分析经常需要用到的数据库，今天学习了一下怎么在其官网上下载数据集 以下以下载肾上腺皮质癌患者的miRNA表达数据为例，来讲解具体的过程 第一步，打开TCGA网址：https://portal.gdc.cancer.gov 第二步，点击导航栏最右 ...

Cohort 英文名称 中文名称 ACC Adrenocortical carcinoma 肾上腺皮质癌 BLCA Bladder Urothelial Carcinoma ...

http://mirgator.kobic.re.kr/help.html ...