一 提取样本： 提取样本见命令行： plink bfile file noweb keep sampleID.txt recode make bed out sample 其中，sampleID.txt第一列为提取的样本Family ID，第二列为Within family ID IID 同样的，如果是去除样本，则用参数 remove 二 提取SNP位点 plink bfile file extr ...
2018-05-04 16:47 0 2336 推荐指数：
1、下载安装bcftools。 2、准备样本ID文件，这里命名为samplelistname.txt，一个样本一行，如下所示： sample1 sample2 sample3 3、输入命令： bcftools view -S samplelistname.txt ...
1、bcftools提取指定区段的vcf文件 下载安装bcftools 见如下命令： bcftools filter 1000Genomes.vcf.gz --regions 9:4700000-4800000 > 4700000-4800000.vcf 注意：输入 ...
1、测试数据 2、提取 3,5,7,8,9,15,17行 使用sed 使用awk 使用while语句： while + awk ...
linux系统中批量提取指定列的数据。 1、测试数据 2、提取 3,5,7,8,9,15,17列 3、awk提取 4、while语句 ...
1、 ...
grep查找ERROR，定位位置 awk打印到指定行数 sed打印到文本末尾 awk打印到文本末尾 方法一 方法二 请教大神得到的多种方法 ...
Newtonsoft.Json.dll retString原始数据 ...
假设有文件长如下样子： CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT samplename 1 35 ...
