1)集合子集 对于给定的集合S={1,2,3},求其所有子集。LintCode 一种通常的做法是:对于集合中的任意一个元素e,有两种可能:被选中作为子集中的元素,或否。因此,一个包含N个元素的集合,共有2^N个子集。如上例,其所有子集如下: s0={}, s1={1}, s2={2}, s3 ...
.基本概念 大部分的二倍体细胞,比如人类体细胞,拥有两份基因组,一份来自于父亲,另一份来自于母亲,每一份基因组大概有 亿个碱基。 在不同个体中,基因组的碱基内容大部分是相同的,只有少部分是不同的,这些不同的就成为SNP 单核苷酸多态性 。 在某一个碱基上,如果来自父本和母本的碱基不同时,则称该区域为杂合子 Heterozygous 。由于个体的体细胞染色体基本上时配对的,这给杂合子的存在提供了可 ...
2018-04-18 10:09 0 1584 推荐指数:
1)集合子集 对于给定的集合S={1,2,3},求其所有子集。LintCode 一种通常的做法是:对于集合中的任意一个元素e,有两种可能:被选中作为子集中的元素,或否。因此,一个包含N个元素的集合,共有2^N个子集。如上例,其所有子集如下: s0={}, s1={1}, s2={2}, s3 ...
杂合度计算分为两种:位点杂合度和样本杂合度 1、计算位点杂合度,测试数据如下: 2、--hardy计算位点杂合度 2、--het 计算样本杂合度 首先要剔除没有多态的位点: ...
面向组合子 面向组合子(Combanitor-Oriented),是最近帮我打开新世界大门的一种pattern。缘起haskell,又见monad与ParseC,终于ajoo前辈的几篇文章。自去年9月起正式回归C#以来,我又逐渐接受了不少新的paradigm(虽然主要原因还是在学 ...
1、测试数据 2、计算观测杂合度和期待杂合度 ...
如下图片所示: 对于位置为48245131的allele来说,REF为A,ALT为C 想确定变异到底是纯合还是杂合,即两条染色体是否同时发生了变异,则看GT,GT对应的数值为0/1,说明该变异为杂合; 如果GT对应的数值为0/0,说明该变异为纯合。 ...
引用来自http://www.cnblogs.com/wuyiqi/archive/2012/03/12/2391960.html的思想; 首先有一个有向连通图,每个点带有一个权值,例如: ...
在测序一个新物种时,首先需要对该物种的基因组结构有所了解,包括以下几个内容: 基因组大小 重复片段大小 杂合度大小 基因组越大,杂合度也大,重复片段越大,该物种的组装难度就越大。通常我们会通过genome survery分析,对以上几个指标 ...
《Fish and Scales》 作者:埃舍尔 本系列文章目录: 一:前言及基础 二:推断 FIX、g 的类型 三:实现 Y 组合子 四:实现 Θ 组合子 五:推导装配脑袋的 Fix ...