:1303.3997v2 摘要 BWA-MEM is a new alignment algorithm for ...
.supplementary alignment supplementary alignment是指一条read的一部分和参考区域 比对成功,另一部分和参考区域 比对成功,参考区域 和参考区域 没有交集 或很少 ,那么一条read就会产生两条sam文件, 将其中的一条sam文件作为represent alignment,而另一条作为supplementary alignment flag为 。 ...
2018-04-16 16:57 0 980 推荐指数:
:1303.3997v2 摘要 BWA-MEM is a new alignment algorithm for ...
一 建立索引 比对之前,需要对fasta文件构建FM-index索引:bwa index -a bwtsw hg19.fasta 生成 hg19.fasta.amb、hg19.fasta.ann、hg19.fasta.bwt、hg19.fasta.pac、hg19.fasta.sa ...
sudo apt-get -y install: -y:yes,在命令行交互提示中,直接输入 yes; sudo apt-get -f install -f:解决包依赖的问题 ...
自己编写的,不能直接套用,理解后可自行变化: $var=explode(' ',$res['act_starting']); $var1=$var[0]; ...
bwa的使用需要两中输入文件: Reference genome data(fasta格式 .fa, .fasta, .fna) Short reads data (fastaq格式 .fastaq, .fq)step 1: 建立 Index根据reference genome ...
1、在命令行中启动Python脚本的时候,经常会用到-m参数,那么-m起了什么作用呢? 2、先看看 python --help 给出的信息: run library module as a script (terminates option list) 意思是将库中 ...
在命令行中使用python时,python支持在其后面添加可选参数。 python命令的可选参数有很多,例如:使用可选参数h可以查询python的帮助信息; 可选参数m 下面我们来说说python命令的另一个可选参数m 首先我们可以使用 python -h来看看python自带的帮助信息 ...
date('Y-n-j') 2020-8-20 date('Y-m-d') 2020-08-20 就是有零和没零的区别 ...