(GO) 项目正是为了能够使对各种数据库中基因获基因产物功能描述相一致的努力结果。 所谓的 GO,是生物 ...
参考:https: www.cnblogs.com xiaojikuaipao p .html https: blog.csdn.net ygyxl article details GO 注释主要有两种方法:序列相似性比对 BLAST 和结构域相似性比对 InterProScan . 将基因序列与swiss prot蛋白质数据库进行 BLAST 比对,得到如下结果: c g i RNF MOUSE ...
2018-03-29 09:20 0 6214 推荐指数:
(GO) 项目正是为了能够使对各种数据库中基因获基因产物功能描述相一致的努力结果。 所谓的 GO,是生物 ...
1、GO资源简介 由于生物系统的惊人复杂性和需要分析的数据集的不断增加,生物医学研究越来越依赖于以可计算的形式存储的知识。基因本体论(GO)项目为基因功能和基因产物的可计算知识提供了目前最全面的资源。GO知识库由两个主要部分组成: 基因本体论Gene Ontology (GO),提供了生物功能 ...
Go实现简单的数据缓存过期功能(类似Redis Expire) ...
一直都搞不清楚这两者的具体区别。 其实初学者搞不清楚很正常,因为它们的本质是相通的,都是对基因进行归类注释的数据库。 建议初学者自己使用一下这两个数据库,应该很快就能明白其中的区别。 以下以一个案例来详细说明两者的区别: 推荐一个没有任何基础的人都能使用的gene set注释工具 ...
本文主要是对没有GO term库的植物进行注释。 1、选用AgriGo 进行注释,在agriGO中点击species后,查看与你目标物种相近的物种作为库 2、比如我以甜菜为例 为了找到和GO term对应的ID,先找到PLAZA,进入网站https ...
Gene Ontology (GO) 注释 Posted on 2017-06-11 | In 生信 相似的基因在不同物种中,其功能往往保守的。显然,需要一个统一的术语用于描述这些跨物种的同源基因及其基因产物的功能,否则,不同的实验室对相同的基因的功能的描述不同,将极大限制学术 ...
但凡是做过基因表达数据分析的(芯片、RNA-seq,scRNA-seq),肯定是跑过基因集功能注释和通路富集的,因为它是研究未知基因集的利器。 但跑过之后老板肯定会给反馈,通常得到的注释都是没有太多意义的,偶尔能随缘得到一些满意的注释,所以常见的注释数据库是有显而易见的缺点的。 而往往 ...
title: go 注释讲解 author: "edte" tags: ["go"] date: 2020-06-01 引言 注释的重要性不言而寓,而怎么编写注释也是需要我们学习的,最好的学习教程就是源码,这篇文章将大量参考 go 库文件源码。 分类 go 的注释有行注释 ...