LncRNA设计原则 LncRNA的引物设计跟mRNA的引物设计类似,都遵循以下规则: 1.引物应在核酸系列保守区内设计并具有特异性。2.扩增产物长度在 80-150bp。最长不要超过 300bp。3.产物不能形成二级结构(自由能小于 58.61KJ/mol)。4.引物长度:一般在 17-25 ...
见文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA Seq of Cancer Samples Overall, of lncRNAs can be detected in the samples, with antisense and lincRNAs the two most abundant categories. lncRNA的两大类要知道。 ln ...
2018-03-27 15:42 0 881 推荐指数:
LncRNA设计原则 LncRNA的引物设计跟mRNA的引物设计类似,都遵循以下规则: 1.引物应在核酸系列保守区内设计并具有特异性。2.扩增产物长度在 80-150bp。最长不要超过 300bp。3.产物不能形成二级结构(自由能小于 58.61KJ/mol)。4.引物长度:一般在 17-25 ...
Novel LncRNA的选择 novel LncRNA选择的原则: 1.不能选与其他基因exon重叠的lncRNA,否则,RT-qPCR结果就混合了两个基因的表达量。 2.最好选择基因间的lncRNA,即lincRNA,跟其他基因没有重叠。 3.其次选择位于其他基因intron区域 ...
featureCounts真的很厉害。 常见的参数(没什么好说的,毕竟是固定的): -a -o input_file1 -F -t -g -Q -T 关键是以下几个参数怎么设 ...
https://blog.csdn.net/hustqb/article/details/77922031 评分参数定义模型评价规则 ...
定义 定量分析是通过对大量样本、数据等客观数据对用户的特征、需求场景、目标、行为进行研究分析的过程。 为什么要进行定量分析 定量分析可以快速地面对更多、更广的用户,因此可以用于在定性研究中发现的问题和用户需求(判断用户需求的真伪),让定性需求更有说服力; 定量分析可以用来确定 ...
最近做定量表达,使用了命令如下: bedtools coverage -a all.bed -b file.sort.bam > file.coverage.txt 使用以上命令正常定量,但更多时候会出现Bus error或者Killed的报错;能不能正常运行,很大程度上取决于系统的资源 ...
目前人们对lncRNA认识还处在初级阶段,lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而大量研究表明,lncRNA在细胞核内、核外,通过染色质修饰,转录调控,转录后调控等多种方式调节基因表达,在肿瘤发生发展中具有重要作用 ...
------------------------------- Long noncoding RNAs are rarely translated in two human cell lines. ...