质控工具之TrimGalore使用方法
TrimGalore 就是一个简单的perl wrapper，打包了fastqc和cutadapt，但是却非常实用。 因为cutadapt的参数选择实在是有够复杂，光接头类型就有5种，还有各种参数，大哥，我就想去去接头、trim一下质量而已，你就不能自动搞了吗。不要给选择困难症的我这么多 ...
原文：质控工具之cutadapt的使用方法
cutadapt 参考：用cutadapt软件来对双端测序数据去除接头 fastqc可以用于检测，检测出来了怎么办 看了几篇高水平文章，有不少再用cutadapt，虽然有时候数据真的不错，但是还是要质控一下，修剪一下。 cutadapt a ADAPTER FWD A ADAPTER REV o out. .fastq p out. .fastq reads. .fastq reads. .fas ...
2018-03-26 20:03 0 1357 推荐指数：
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