原文:比较基因组分析

. 基因家族聚类 基因家族是来源于同一个祖先,由一个基因通过基因重复和物种分歧而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因,它们在结构和功能上具有明显的相似性,编码相似的蛋白质产物,同一家族基因可以紧密排列在一起,形成一个基因簇,但多数时候,它们是分散在同一染色体的不同位置,或者存在于不同的染色体上的,各自具有不同的表达调控模式。基因家族的鉴定,是进化分析很重要的一个方面 OrthoMCL http: ...

2018-03-24 13:05 2 8163 推荐指数:

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基因组分析方案

目录 一、研究内容 1.比较基因组分析 2. 核心基因/非必需基因分析基因组大小模拟 核心基因/非必需基因功能富集 核心基因/非必需基因保守性分析 核心基因/非必需基因与重复序列相关性 ...

Fri Jul 23 07:30:00 CST 2021 0 279
第二代无创胎儿基因组分析结果

第一代无创产前诊断是通过染色体倍数异常来判断的,最典型的就是先抽取孕妇的外周血,提取游离DNA,通过高通量测序技术分析每染色体片段,判断胎儿是否是21号三倍体。第二代无创产前诊断分析的是基因突变诊断。 最新这篇文章通过针对母体血浆DNA进行全基因组测序(195×和270×单倍体基因组覆盖),探索 ...

Sat Nov 05 00:54:00 CST 2016 1 1476
基因组测序及分析

基因组测序: 浓度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA两次需要量>=3ug 宏基因组测序需要提供什么样品要求? (1)提供环境微生物的基因组DNA或者扩增产物,OD值在1.8 ...

Wed Aug 02 05:39:00 CST 2017 0 1129
GWAS全基因组关联分析

出处:bilibili 关联分析(Association):在交易数据、关系数据或其他信息载体中 ...

Sun Jun 13 23:55:00 CST 2021 0 4672
基因组分箱软件metaWRAP报错记录与解决方法

最近学习微生物宏基因组分箱(binning),按官方文档安装metaWRAP,踩了一堆坑,记录一下报错及解决方法: 1. metaWRAP安装 安装教程及下载地址:GitHub - bxlab/metaWRAP: MetaWRAP - a flexible pipeline ...

Mon Nov 29 02:14:00 CST 2021 0 2123
基因组共线性分析工具MCScanX

软件简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整,用于检测共线性和同线性区域,还增加了可视化和下游分析。。MCscanX有三个核心工具,以及12个下游分析工具。 软件安装 进入官网http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm,下载安装 ...

Tue Mar 17 20:54:00 CST 2020 0 3218
基因组关联分析(GWAS):为何我的QQ图那么飘

前段时间有位小可爱问我,为什么她的QQ图特别飘,如果你不理解怎样算飘,请看下图: 理想的QQ图应该是这样的: 我当时的第一反应是:1)群体分层造成的;2)表型分布有问题。因此让她检查一下数据 ...

Sun Jun 30 03:54:00 CST 2019 0 1568
 
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