前言 做RNA-seq基因表达数据分析挖掘，我们感兴趣的其实是“基因互作”，哪些基因影响了我们这个基因G，我们的基因G又会去影响哪些基因，从而得到基因调控的机制。 直觉确实是很明确的，但是细节处却有很多问题。 我们讨论的到底是基因表达的互作，还是基因产物的互作 ...

打开Cytoscape软件，根据菜单导入string_interactions.tsv文件 File ----> Import ----> Network from File 会弹出下图对话框，在对话框中设置如下： 选中string_interactions.tsv文件，点击 ...

igaph 是一个项目，目标是建立一条简单，易用的网络分析工具，有 R, python, C/C++ 等语言的具体实现； 项目主页： http://igraph.org/ 在R语言中，对应的就是 igraph 这个R包 安装： 使用： 对于图 graph 这种 ...

R语言构建蛋白质网络并实现GN算法 目录 R语言构建蛋白质网络并实现GN算法 1.蛋白质网络的构建 2.生物网络的模块发现方法 3.模块发现方法实现和图形展示 1) 基于点连接的模块发现 ...

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目录 1. 简介 2. 近几年发表的主要工具 1.DeepRT 2.Prosit 3. DIANN 4.DeepDIA 1. 简介 基于串联质谱的蛋白质组学大部分是依赖于数据库（database search ...

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