Fst指数说明
群体遗传学--Fst指数，即群体间分化指数，用于群体间分化分析。 群体遗传学中衡量群体间分化程度的指标有很多种，最常用的就是Fst指数。Fst指数，由F统计量演变而来。F统计量（FIS，FIT，FST）主要有三种。Fst是针对一对等位基因，如果基因座上存在复等位基因，则需要用Gst ...
原文：使用vcftools或者gcta计算群体间固定指数（Fixation index，FST）
下列所用到的数据均为千人基因组数据库 通过vcftools计算FST 命令行如下： 其中，input data.vcf就是输入的vcf格式 population .txt的格式如下： population .txt的格式同population .txt，只有一列sample名字的信息。 计算之后，会得到两个文件格式，分别为.log和.fst,如图下所示： 通过gcta计算FST 命令行如下： 其中 ...
2018-03-15 11:22 5 3939 推荐指数：
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