Pathway富集分析气泡图
data.tsv > pathway = read.table("data.tsv",header = T, sep="\t") > library(ggplot2) > p = ggplot(pathway,aes(Pvalue,Pathway)) > ...
原文：pathway-pathway network 网络分析
对于pathway 数据库而言，我们最常见的就是利用KEGG 富集分析挖掘其中的信息，得到显著富集的几条通路 对于代谢通路而言，不同的通路之间是会有相互关系的，比如在上游的通路中产生的代谢产物，进入下游的通路继续发挥作用。 pathway和pathway 之间存在一个上下游的关系，所有的pathway 的相互关系就构成了 个网络，在这个网络中，肯定会存在degree比较多的pathway, 所以通 ...
2018-02-23 15:17 0 1317 推荐指数：
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