原文:Deseq2 的可视化策略汇总

MA图 对于MA图而言, 横坐标为该基因在所有样本中的均值,basemean basemean A basemean B , 纵坐标为 log Fold change 其中,pvalue lt . 以下的点被认为是差异基因,标记为红色 count 图 单个基因在不同组样本中的分布 为了防止样本表达量相同时,点出现重合的情况,添加了扰动 library ggplot ggplot d, aes x ...

2018-02-22 11:21 0 3449 推荐指数:

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Error in library(DESeq2) : 不存在叫‘DESeq2’这个名字的程辑包

在安装‘DESeq2’这个包的最后出现上面的错误。可以看出是‘Biobase’这个包有问题。重新安装此包后,再一次安装‘DESeq2’,安装成功。 library('DESeq2')出现下面问题: 缺少GenomeInfoDb包,继续安装 ...

Wed Dec 06 22:44:00 CST 2017 1 7426
DESeq2 install --- 如何安装R包("RcppArmadillo")?

安装R包(“RcppArmadillo”)失败,导致依赖该包的DESeq2 无法使用; 首先对gcc,g++升级至4.7, 但依然报错,还是安装不了RcppArmadillo; 报错如下: $ R > source("https://bioconductor.org ...

Thu Feb 16 21:15:00 CST 2017 0 2410
web可视化图形编辑器汇总

欢迎关注前端早茶,与广东靓仔携手共同进阶 前端早茶专注前端,一起结伴同行,紧跟业界发展步伐~ 公众号作者:广东靓仔 前言: 有些时候,我们需要使用到可视化绘图的编辑器。这里给大家收集了一些,如下所示。 正文: 1.mxgraph: 介绍:开源免费,但是需要 ...

Sat Mar 06 00:49:00 CST 2021 0 1341
简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析

简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析 Posted: 五月 07, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析,主要也是用于RNA-Seq数据,同样也可以处理类似 ...

Sat Nov 10 05:33:00 CST 2018 0 4084
SQLite可视化管理工具汇总

搜集了一些SQLite工具,在这里做个总结,有的工具用的多一些,有的只是简单试用,甚至未试用,所以有描述不当的还请回复指正,也欢迎补充完善! 2015-03-11 更新情况: SQLiteSpy最 ...

Fri Apr 14 01:01:00 CST 2017 0 5773
漂亮又好用的Redis可视化客户端汇总

因为 Redis 官方只提供了命令行版的 Redis 客户端 redis-cli,以至于我们在使用的时候会比较麻烦,通常要输入一堆命令,而且命令行版的客户端看起来也不够直观,基于以上两个原因我们需要找一个可视化的 Redis 客户端,下面是我这些年使用过的一些 Redis 可视化客户端,分享 ...

Fri Jun 19 21:36:00 CST 2020 2 3749
数据可视化(二)

本文来源:https://www.dataquest.io/mission/132/data-visualization-and-exploration 本文数据来源https://github.c ...

Wed Mar 02 19:23:00 CST 2016 0 8939
 
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